آیت الله اعرافی در جلسه شورای معاونین  مرکز مدیریت حوزه های علمیه که در مدرسه علمیه معصومیه قم برگزار شد، بر ارتقای شبکه بزرگ فضای مجازی سایبری، تبلیغ و مرکز رسانه و ورود جدی حوزه به این مباحث مهم تأکید کرد و گفت: ارتقاء دانش و مهارت افزایی در هریک از موارد می تواند حوزه را به اهداف از پیش تعیین شده کمک و یاری کند.
مدیر حوزه های علمیه تعیین کارگروهی برای تربیت مربی در قالب رشته ها، برگزاری دوره های مهارتی کاربردی  و نوع فعالیت هر یک و بازنگری سند تحول هر چند سال یک بار در ستاد همکاری هاهای آموزش و پرورش برای رسیدن به اهداف و برنامه های تنظیم شده در مدیریت جدید را ضروری دانست.
وی شناسایی و حمایت از معماران و افراد برجسته در حوزه برای رشد و تعالی آینده حوزه را ضروری دانسته و بر اهمیت توجه جدی تر به ورودی حوزه متناسب با اهداف و برنامه های آمایش را تأکید کرد و گفت: برای این که اهداف و طرح آمایش و رسالت های حوزه به درستی پیش برود، باید نگاه جدی تری به ورودی حوزه متناسب با طرح آمایش داشته باشیم.
عضو فقهای شورای نگهبان بیان داشت: اگر به این روند توجه جدی شود دیگر طلاب و روحانیون در بحث معیشت با مشکلی مواجه نخواهند شد، چون افراد براساس استعدادها  در جای های خود به کارگیری خواهند شد. 
وی بیان داشت: به همین دلیل برنامه های چون هدفمندی شهریه، راه اندازی تربیت معلم و سیاست های متعددی طراحی شده است.