آیت الله اعرافی در پاسخ به پیام شجاعانه شیخ منیب الرحمن مفتی اعظم پاکستان در محکوم نمودن تحریم های ظالمانه آمریکا علیه جمهوری اسلامی ایران به ویژه در شرایط بحرانی کنونی و شیوع ویروس کرونا؛ از این پیام قدردانی کرد. متن پیام آیت الله اعرافی بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
قُلْ لَنْ یُصِیبَنَا إِلَّا مَا کَتَبَ اللَّهُ لَنَا هُوَ مَوْلَانَا وَعَلَی اللَّهِ فَلْیَتَوَکَّلِ الْمُؤْمِنُونَ
اللَّهُمَّ اجْعَلْنِا فِی دِرْعِکَ الْحَصِینَةِ الَّتِی تَجْعَلُ فِیهَا مَنْ تُرِیدُ
حضرت مولانا شیخ منیب الرحمان زیدعزه
دبیر محترم اتحادیه تنظیم المدارس پاکستان
الحمدلله رب العالمین و أفضل الصلاة و السلام علی خاتم النبیین محمد و آله الطیبین الطاهرین و اصحابه المنتجبین
السلام علیکم و رحمة الله و برکاته؛
در ایامی که حادثه ناگوار انتشار ویروس کرونا مایه رنج و مصیبت کشورها و ملت ها و موجب غم و اندوه عالمان و حوزه های علمیه شده است ، پیام جناب عالی در محکومیت تحریم های ظالمانه امریکا علیه ایران اسلامی که حتی از ارسال داروها به ملت ایران هم دریغ می کنند موجب تقدیر و تشکر گردید و نشان از شجاعت ، اخوت اسلامی و ایمانی جناب عالی و همدلی علمای پاکستان و بصیرت دنیای اسلام دارد .
حوزه های علمیه و بزرگان دین در قم و ایران ضمن ابراز همدردی با مصیبت دیدگان و آسیب زدگان از پیروان همه ادیان وهمه ملت های جهان، آرزوی دوری همه بلاها و نابسامانی ها از جهان ورحمت الهی برای جانباختگان و شفای عاجل برای بیماران را از خداوند منان دارد و از عالیجناب و همه علمای سنی و شیعه پاکستان و مدارس دینی و تلاشگران و دولت و ملت پاکستان که برای وحدت هر چه بیشتر دو کشور ایران و پاکستان همدلی و همکاری می نمایید صمیمانه متشکرم .
حوادث و بلایای طبیعی در منطق ادیان آسمانی پدیده هایی هشداردهنده برای آزمون بشر ، زمینه ساز تکامل و تعالی انسان ، مایه بصیرت نسبت به مبدا و معاد ، فرصتی برای سنجش و تجلی خصلت‌های انسانی و اجتماعی و شکوفایی روح همدلی ، ایثار و فداکاری جامعه انسانی است .
حوزه علمیه قم به تاسی از رهبری معظم و مراجع عظام تقلید دامت برکاتهم ، مبنای مواجهه خود در این بحران را اهتمام به نظرات کارشناسی و توصیه های علمی و بهداشتی ، تبیین صحیح ، عقلانی و حکیمانه ابتلائات ، پرهیز از دوقطبی غیرواقعی علم و دین ، توسعه پژوهشهای ناظر به معالجه آسیب ها و معضلات اجتماعی ، استمرار شور و نشاط اجتماعی و اقتصادی، تقویت همبستگی اجتماعی و تحکیم امید ، عزم ، اراده ، ارامش ، مهربانی و خلاقیت  در جامعه، تحکیم مبانی اعتقادی و توجه به ضرورت تزکیه ی نفس و صیانت جامعه از ناهنجاری ها و آلودگی ها و نیز توجه به قدرت لایزال خداوند متعال و  اهتمام به دعا و تضرع در پیشگاه خداوند قرار داده است .
روحانیت شیعه همواره بر ارادت و پیمان خود با خداوند و پیامبر مکرم اسلام صلی الله علیه و اله و اهل بیت مطهرش علیهم السلام  و خدمت به انسانیت ایستاده اند و خواهند ایستاد و با الطاف الهی ، این روزها در جمهوری اسلامی ایران  شاهد جلوه های وصف ناشدنی از حرکت های داوطلبانه و همدلی ها و همکاری های گسترده دولت و ملت ومردم  و وحدت اسلامی از همه گروه ها و ادیان و مذاهب و پرستاران و پزشکان و کادر درمان و جوانان ودانشجویان و نخبگان دانشگاهی  وروحانیت و حوزه های علمیه وبزرگان دین  و طلاب علوم دینی  وجوانان امدادگر هستیم و بر این پیوند آسمانی افتخار می کنیم .
متاسفانه در این ایام سخت که بر همه امت اسلامی بویژه مردم ایران سپری می گردد، استبار جهانی اقدام به تنگ تر نمودن دایره تحریم ها بر ملت ایران نموده اند  امیدواریم با توکل بر ساحت ربوبی و توسل به ارواح مقدس حضرات معصومین علیه السلام و با تکیه بر توان و اراده و ایمان اسلامی  و همدلی و همکاری همه امت سربلند اسلامی بتوانیم از این صحنه دشوار نیز موفق و عزیز و با عافیت عبور کنیم .
لازم می دانم عرض نمایم که  حوزه های علمیه ایران مصر است تا نظامات علمی و آموزشی و تربیتی حوزه با این حوادث، توقف و عقبگرد نکند و از همه ابزارها و فناوری‌ها به ویژه ظرفیت فضای مجازی و غیر حضوری و روش‌های  نوین برای تداوم پویایی حوزه ها بهره بگیرد و  تلاش می نماید اصل بازآفرینی حوزه درفضای مجازی را تحقق بخشد.  بحمدالله حوزه با شتاب به این سمت حرکت کرده و اکنون بخش عمده آموزش‌های حوزوی حتی برخی از درس های سطوح عالی و درس خارج در فضای مجازی در حال اجراست .
در پایان از خداوند متعال می خواهم کشورهای اسلامی و نخبگان و عالمان مسلمان و مراکز و مجامع علمی و دینی را از جمیع بلیات ارضی و سماوی مصون و محفوظ داشته و فرصت را مغتنم دانسته و آمادگی حوزه های علمیه ایران در ارتباط و همکاری با اتحاد تتظیم المدارس و مدارس و حوزه های ان را مجددا اعلام میدارم .
و السلام علیکم و رحمة الله و برکاته
علیرضا أعرافی
مدیر حوزه های علمیه ایران
قم المقدسه