متن پیام رهبر انقلاب اسلامی به شرح زیر است:
 

بسم الله الرحمن الرحیم
 

درگذشت استاد دانشمند جناب آقای دکتر کریم مجتهدی رحمةالله‌علیه را به جامعه‌ی دانشگاهی کشور و شاگردان فرزانه‌ی ایشان و خاندان مجتهدی تبریز تسلیت عرض میکنم.
دانش عمیق، نگاه انتقادی به فرهنگ غرب که خاستگاه تحصیلیِ او بود و تربیت شاگردان فراوان، از ویژگی‌های این فیلسوف غرب‌شناس بود.
مغفرت الهی را برای او مسألت می‌کنم.
 

سیدعلی خامنه‌ای