سومین شورای مدیران با حضور آقایان دکتر ملکی، دکتر مرتضایی، دکتر امانی، دکتر رون، دکتر علی محبی، دکتر عظیم محبی، دکتر دوراندیش، دکتر اسدی، مهندس باهو، مهندس نیک نژاد، مهندس امینی، آقایان امیری نیا، خادمیان، محمدی، جلالی، رضا علی، و روشندل در سالن جلسات سازمان پژوهش برگزار شد.
 پس از تلاوت آیاتی از کلام الله مجید، آقای دکتر ملکی در خصوص آیات تلاوت شده بیان داشت:این آیات هشدار می‌دهد غرور و تکبری که برخی از انسانها در زندگی گرفتار آن می‌شوند عامل بدبختی و بیچاره گی آنها است همان چیزی که شیطان را از نزدیکی و قرابت خداوند متعال به زیر کشید. تکبر و غرور باعث می‌شود انسان هم در دنیا و هم در آخرت سرنگون شود. یکی از چیزهایی که باعث غرور انسان می‌شود آن است که آغاز پیدایش خود را فراموش کند، انسان اگر چگونگی آفرینش خود را به خاطر آورد فرود خواهد آمد و دچار تکبر نخواهد شد. این آیات تذکری است برای همه ما که بدانیم اگرچه از نظر معنوی و اعتقادی به مصداق آیه " إِنَّا للّه وإِنّا إِلَیهِ رَاجِعُونَ" از سوی خدا هستیم اما از جهت مواد اولیه و علل معدّه پیدایش ما معلوم است که از کجا آمده‌ایم؟ و چگونه به وجود آمده‌ایم؟ بنابراین نباید غرور داشته باشیم و بالعکس باید همیشه مراقب حال خود باشیم.
 رئیس سازمان پژوهش و برنامه ریزی آموزشی پس از تشریح آیات تلاوت شده تصویب ساختار تشکیلاتی سازمان را به مدیران و همه اعضای سازمان مژده داد و گفت:خدا را به خاطر این عنایت و لطفش سپاسگزاریم.
دکتر ملکی ادامه داد:خوشحالم از اینکه واژه برنامه‌ریزی درسی با توجه به غربت آن در سال‌های اخیر در عنوان دفاتر تألیف آمد.
سپس نکاتی به عنوان پیش از دستور مانند اجرای مصوبه ستاد ملی کرونا در خصوص عدم پذیرایی در جلسات و مراقبت از این موضوع توسط دکتر مرتضایی معاون توسعه منابع و پشتیبانی سازمان مطرح شد.
در ادامه دکتر ملکی به عنوان نکات پیش از دستور بیان داشت: با توجه به حاد شدن ویروس کرونا و رسیدن به وضعیت هشدار، رعایت موارد بهداشتی و فاصله گذاری اجتماعی را مد نظر قرار دهیم. در این شرایط بحرانی و حساس وظیفه همه ما در سازمان این است که خودمان را برای مواجهه با شرایط قرمز و زرد آموزشی آماده کنیم تا در این اوضاع خاص که برای همه ما یک آزمون است ان شالله آبرومند بیرون بیاییم. در خصوص اوضاع قرمزی که دانش‌آموزان امکان حضور در مدرسه را ندارند و اینکه چه اقدامات و تغییراتی باید در کتاب‌های درسی اعمال کنیم تدبیر کنیم، در واقع هم معلم بتواند بهتر و آسانتر به شیوه مجازی آموزش دهد، هم دانش‌آموزان بتواند آسان‌تر درک کنند و دریابند و هم والدین احساس کنند با مسئله خاصی و حادی مواجه نیستند. کار اصلی دفاتر تألیف در وضعیت قرمز این است که برای تک تک دروس مشخص کنند چه بخشی از کتاب و دروس در آموزش مجازی نیاز به تدریس ندارد. لازم به ذکر است در این بخش نباید تصور کنیم که مبحثی حذف شود زیرا بحث حذف مطرح نیست. دومین اقدام در همین راستا این است که با توجه به اوضاع حاکم و آموزش مجازی آیا در کتاب درسی می‌توان سازمان مطالب را تغییر داد؟ .
اقدام سوم این است که محتوای کتاب از جهت بُعد روشی تکالیف و فعالیت‌ها چه تغییراتی لازم دارند تا فضای مجازی متناسب‌تر شود. در فضای مجازی هدف‌های تربیتی با توجه به فلسفه تعلیم و تربیت ثابت هستند و قابل تغییر نیستند، ما در بخش محتوا می‌توانیم چرخش و مانور مفهومی داشته باشیم به نحوی که با آموزش فضای مجازی سازگارتر شود.  با توجه به کاهش زمان آموزشی و محدودیت‌های این حوزه، باید درباره تک تک دروس تصمیم‌گیری شود. در نظر داشته باشیم شرایط به گونه‌ای است که اگر سازمان کارش را به درستی انجام ندهد دیگران کار سازمان را انجام خواهند داد زیرا دچار بحران هستیم و مکلفیم به وظایفمان به درستی عمل کنیم .
کار دیگری که باید به موازات وظایف سازمانی انجام شود این است که با توجه به تولید محتوای الکترونیکی در بیرون از سازمان فراخوانی داده شود تا تولیدات خارج از سازمان از طریق فراخوان به دبیرخانه تولید محتوای الکترونیکی که باید در دفتر انتشارات و رسانه های آموزشی مستقر شود ارسال گردد. تولیدات ارسال شده از نظر آموزشی، فرهنگی، ارزشی، فکری و تربیتی مورد ارزیابی قرار گیرد و آنهایی که مناسب تشخیص داده شد در شبکه ملی رشد بارگذاری شود. باتوجه به آماده نبودن بستر شبکه رشد مقرر شد از طریق تفاهم نامه یا توافق نامه‌ایی با سرور ها و امکانات خارج از سازمان بستری فراهم شود تا معلمان دانش‌آموزان و والدین از این محتوا بهره‌مند گردند.
پس از طرح نکات مقدماتی و پیش از دستور توسط اعضای جلسه، در همورد موضوع جلسه اصلی با عنوان "نحوه تهیه طرح تفصیلی ساختار تشکیلاتی سازمان" مورد بحث و گفتگو قرار گرفت.
در ابتدا دکتر ملکی ساختار مصوب سازمان را تشریح کرد و افزود: در ساختار مصوب سازمان چهار دفتر جدید اضافه شده است. اولین دفتر با عنوان دفتر توانمندسازی و آموزش مدرسان عالی است که وظیفه‌اش آموزش معلمان در حوزه تغییرات برنامه‌های درسی و برنامه‌های نوپدید درسی در راستای وظایف و اختیارات قانونی می‌باشد. دفتر دوم دفتر مطالعات راهبردی و آینده پژوهی است وظیفه این دفتر مطالعاتی است که بتوانیم آینده را تا حدودی مدیریت و کنترل کنیم. سومین دفتر اضافه شده دفتر سیاستگذاری فناوری اطلاعات و ارتباطات است دفتر چهارم دفتر نظارت و ارزشیابی از برنامه های درسی است. با توجه به اینکه بخش عمده وظایف سازمان ارزشیابی و نظارت است ولی تاکنون تشکیلاتی برای آن وجود نداشت به همین دلیل این دفتر به مجموعه سازمان اضافه شد.
معاونت توسعه منابع و پشتیبانی سازمان کما فی السابق به فعالیتش ادامه خواهد داد. معاونت برنامه ریزی درسی و تولید بسته های تربیت و یادگیری شامل سه دفتر خواهد بود زیر مجموعه این معاونت؛ دفتر برنامه‎ریزی درسی و تولید بسته‌های تربیت و یادگیری آموزش عمومی و متوسطه نظری، دفتر برنامه‌ریزی درسی و تولید بسته‌های تربیت یادگیری دوره فنی و حرفه ای و مهارتی و دفتر نشریات و رسانه‌های آموزشی می‌باشد. آنچه گفته شد ساختار کلی سازمان بود که مصوب شد ولی برای این ساختار کلی باید طرح تفصیلی تهیه شود تا به سازمان امور استخدامی ارسال گردد بنابراین باید از نظر متدولوژی روشی برای انجام این کار اتخاذ کنیم. باید کارگروه هایی تشکیل شوند تا از طریق مباحثه و گفتگو‌هایی که انجام می‌شود از نظر کمی و کیفی اقدامات ویژه صورت گیرد. یازده حوزه تربیت و یادگیری باید وارد دفاتر برنامه‌ریزی و تولید بسته‌های تربیت یادگیری شود. برخی حوزه‌ها مانند علوم انسانی و مطالعات اجتماعی سفره وسیعی دارند و برخی دیگر مانند ریاضیات و آداب و مهارت های زندگی چندان وسعت ندارد برای این موارد هم باید تدابیری اندیشیده شود تا در داخل هر حوزه ساختار درونی  آن ساماندهی شود. مهندسی ساختار درونی هر حوزه نیاز به بحث و گفتگو دارد طبیعی است آنچه که در این خصوص به ما جهت خواهد داد برنامه درسی ملی، مبانی سند تحول، یافته‌ها و تحولات علمی نوین و ماهیت هر حوزه می‌باشد که باید ساختار و یکپارچگی درون حوزه را مشخص کند، معین کند ارتباط هر حوزه با حوزه‌های دیگر چگونه باشد. از 11 حوزه مشخصاً یک حوزه به نام کار و فناوری به دفتر فنی و حرفه‌ای ارتباط خواهد داشت در خصوص کار دانش هم باید گفت کار دانش قبلی هیچ فرقی با فنی حرفه ای ندارد در حالی که از ابتدای امر دارای دو ماهیت جدا بودند ولی به دلیل عدم حمایت از کار دانش این شاخه از حیز انتفاع افتاده است. برای برنامه‌ریزی درسی در این حوزه باید چگونه عمل کنیم؟ با توجه به پایبندی به قانون حوزه فنی حرفه‌ای و کار دانش باید بازسازی شود آنچه که تصویب شد ظرف است، برای مطلوبیت مظروف باید عالمانه عمل کنیم، برای ساماندهی تک‌تک دفاتر باید طرح تفصیلی‎ای تدوین شود که هم شایسته سازمان و هم در مراجع قانونی قابل دفاع باشد. مسئول پیگیری تهیه طرح تفصیلی بر عهده آقای دکتر مرتضایی خواهد بود ولی از نظر فکری و نظردهی همه ما مسئول هستیم.
پس از بیان نظرات اعضای جلسه در خصوص تهیه طرح تفصیلی سازمان،  دکتر ملکی نکات زیر را در جمع‌بندی مباحث مطرح شده بیان کرد:
 ساختار با عقلانیت و استحکام به پیش رود زیرا تا 5 سال قابل اصلاح و بازبینی نیست.
به مرزبندی شرح وظایف توجه شود ارتباط وظایف آری اختلاط وظایف خیر.
 امکان ارتباط و تلفیق فعالیت‌ها در ساختار وظایف لحاظ شود طبق الهامی که از برنامه درسی ملی گرفته می‌شود باید ساختار طوری تنظیم شود تلفیق مد نظر قرار گیرد.
 نسبت حوزه های یازده گانه با دو دفتر بدون تعصب مشخص و معین شود.
 دفاتر به نکات حاشیه ای و ولی مهم مانند چند تالیفی، برون‌سپاری، بومی‌سازی و امثالهم در ساختار تفصیلی توجه جدی داشته باشند. ساختار باید طوری باشد که چند تألیفی و برون سپاری را امکان‌پذیر کند.
 جایگاه پژوهش در طرح تفصیلی ساختار دفاتر به طور شفاف مشخص باشد. در جای جای طرح تفصیلی باید پژوهش دیده شود در واقع گروه پژوهش و برنامه‌ریزی و تولید بسته‌های تربیت و یادگیری عنوان دفاتر باشد می‌خواهیم واژه پژوهش و برنامه‌ریزی درسی احیا شود پژوهش یعنی تفکر قبل از عمل.